Научные исследования свидетельствуют о ежегодном сокращении количества водных биоресурсов, замещении ценных пород рыб (рипуса, сига) «сорными» видами, а также снижении их видового разнообразия. Это обусловлено в первую очередь критической криминальной обстановкой, связанной с незаконным выловом рыбы варварскими методами в неограниченном количестве. Вторая причина – низкая эффективность естественного нереста, а, точнее, практически отсутствие последнего, что вызвано неблагоприятным уровневым режимом на водоеме, приведшим к осушению и промерзанию нерестилищ.
Значительный ущерб запасам водных биоресурсов, их кормовой базе наносится водозаборными сооружениями. Согласно подсчетам, проведенным по ценам 2004 года, размер ущерба водным биоресурсам Ириклинского водохранилища может составлять более 7 млн. руб. ежегодно.
По мнению губернатора, со стороны органов власти и местного самоуправления, предоставляющих природные ресурсы водохранилища и прилегающие земли в пользование коммерсантам и гражданам, отсутствует должный контроль за этими пользователями. Процветает попустительский подход к выполнению своих прямых профессиональных обязанностей: исполнили функцию – заключили договоры и забыли.
